Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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GTF3C1Q12789 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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GTF3C1Q12789 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF3C1Q12789 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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GTF3C1Q12789 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF3C1Q12789 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF3C1Q12789 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF3C1Q12789 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF3C1Q12789 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF3C1Q12789 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF3C1Q12789 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF3C1Q12789 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF3C1Q12789 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF3C1Q12789 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF3C1Q12789 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF3C1Q12789 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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GTF3C1Q12789 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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GTF3C1Q12789 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms