Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms