Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms