Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLEQ07864 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLEQ07864 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLEQ07864 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLEQ07864 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLEQ07864 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLEQ07864 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLEQ07864 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLEQ07864 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLEQ07864 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
POLEQ07864 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLEQ07864 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLEQ07864 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLEQ07864 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
POLEQ07864 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLEQ07864 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLEQ07864 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLEQ07864 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLEQ07864 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLEQ07864 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLEQ07864 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLEQ07864 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLEQ07864 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLEQ07864 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLEQ07864 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
POLEQ07864 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLEQ07864 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLEQ07864 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLEQ07864 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLEQ07864 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLEQ07864 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLEQ07864 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLEQ07864 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLEQ07864 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLEQ07864 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLEQ07864 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLEQ07864 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
POLEQ07864 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
POLEQ07864 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLEQ07864 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLEQ07864 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLEQ07864 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLEQ07864 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
POLEQ07864 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
POLEQ07864 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLEQ07864 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLEQ07864 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
POLEQ07864 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLEQ07864 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLEQ07864 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLEQ07864 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLEQ07864 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLEQ07864 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLEQ07864 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLEQ07864 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLEQ07864 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLEQ07864 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLEQ07864 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLEQ07864 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLEQ07864 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLEQ07864 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLEQ07864 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLEQ07864 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLEQ07864 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
POLEQ07864 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLEQ07864 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLEQ07864 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLEQ07864 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLEQ07864 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLEQ07864 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLEQ07864 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
POLEQ07864 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLEQ07864 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLEQ07864 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLEQ07864 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLEQ07864 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLEQ07864 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLEQ07864 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLEQ07864 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLEQ07864 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLEQ07864 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLEQ07864 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLEQ07864 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLEQ07864 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLEQ07864 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLEQ07864 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLEQ07864 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
POLEQ07864 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLEQ07864 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLEQ07864 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
POLEQ07864 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLEQ07864 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLEQ07864 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLEQ07864 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLEQ07864 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLEQ07864 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLEQ07864 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLEQ07864 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLEQ07864 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLEQ07864 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms