Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GABPAQ06546 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms