Protein–RNA interactions for Protein: Q04671

OCA2, P protein, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OCA2Q04671 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OCA2Q04671 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms