Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms