Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
TNFRSF17Q02223 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms