Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms