Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms