Protein–RNA interactions for Protein: Q01459

CTBS, Di-N-acetylchitobiase, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBSQ01459 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTBSQ01459 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms