Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms