Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COG7P83436 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COG7P83436 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COG7P83436 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COG7P83436 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COG7P83436 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COG7P83436 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COG7P83436 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COG7P83436 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COG7P83436 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COG7P83436 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COG7P83436 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COG7P83436 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COG7P83436 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COG7P83436 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COG7P83436 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COG7P83436 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
COG7P83436 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COG7P83436 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COG7P83436 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COG7P83436 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COG7P83436 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COG7P83436 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COG7P83436 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COG7P83436 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COG7P83436 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COG7P83436 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COG7P83436 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COG7P83436 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COG7P83436 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COG7P83436 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COG7P83436 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COG7P83436 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COG7P83436 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COG7P83436 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COG7P83436 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
COG7P83436 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
COG7P83436 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COG7P83436 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COG7P83436 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COG7P83436 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COG7P83436 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COG7P83436 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COG7P83436 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COG7P83436 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COG7P83436 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COG7P83436 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COG7P83436 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COG7P83436 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COG7P83436 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COG7P83436 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COG7P83436 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COG7P83436 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COG7P83436 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COG7P83436 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COG7P83436 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COG7P83436 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COG7P83436 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COG7P83436 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COG7P83436 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COG7P83436 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
COG7P83436 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COG7P83436 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
COG7P83436 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
COG7P83436 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
COG7P83436 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COG7P83436 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COG7P83436 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COG7P83436 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
COG7P83436 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COG7P83436 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
COG7P83436 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
COG7P83436 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COG7P83436 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COG7P83436 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COG7P83436 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COG7P83436 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COG7P83436 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COG7P83436 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COG7P83436 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COG7P83436 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COG7P83436 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COG7P83436 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COG7P83436 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COG7P83436 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COG7P83436 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COG7P83436 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COG7P83436 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COG7P83436 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COG7P83436 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COG7P83436 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COG7P83436 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COG7P83436 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COG7P83436 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COG7P83436 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COG7P83436 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COG7P83436 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COG7P83436 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COG7P83436 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COG7P83436 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms