Protein–RNA interactions for Protein: P80075

CCL8, C-C motif chemokine 8, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL8P80075 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL8P80075 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL8P80075 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL8P80075 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL8P80075 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL8P80075 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL8P80075 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL8P80075 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL8P80075 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL8P80075 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL8P80075 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL8P80075 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL8P80075 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL8P80075 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL8P80075 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL8P80075 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL8P80075 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL8P80075 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL8P80075 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL8P80075 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL8P80075 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL8P80075 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL8P80075 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL8P80075 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL8P80075 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL8P80075 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL8P80075 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL8P80075 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL8P80075 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL8P80075 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL8P80075 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL8P80075 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL8P80075 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL8P80075 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL8P80075 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL8P80075 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL8P80075 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL8P80075 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL8P80075 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL8P80075 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL8P80075 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL8P80075 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL8P80075 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL8P80075 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL8P80075 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL8P80075 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL8P80075 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL8P80075 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL8P80075 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL8P80075 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL8P80075 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL8P80075 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL8P80075 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL8P80075 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL8P80075 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL8P80075 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL8P80075 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL8P80075 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL8P80075 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL8P80075 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL8P80075 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL8P80075 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL8P80075 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL8P80075 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL8P80075 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL8P80075 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL8P80075 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL8P80075 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL8P80075 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL8P80075 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL8P80075 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL8P80075 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL8P80075 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL8P80075 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL8P80075 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL8P80075 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL8P80075 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL8P80075 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL8P80075 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL8P80075 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL8P80075 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL8P80075 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL8P80075 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL8P80075 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL8P80075 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL8P80075 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL8P80075 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL8P80075 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL8P80075 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL8P80075 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL8P80075 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL8P80075 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL8P80075 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL8P80075 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL8P80075 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL8P80075 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL8P80075 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL8P80075 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL8P80075 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL8P80075 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms