Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms