Protein–RNA interactions for Protein: P63267

ACTG2, Actin, gamma-enteric smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG2P63267 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTG2P63267 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms