Protein–RNA interactions for Protein: P62834

RAP1A, Ras-related protein Rap-1A, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAP1AP62834 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAP1AP62834 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAP1AP62834 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAP1AP62834 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAP1AP62834 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAP1AP62834 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAP1AP62834 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAP1AP62834 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAP1AP62834 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAP1AP62834 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAP1AP62834 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAP1AP62834 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAP1AP62834 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAP1AP62834 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAP1AP62834 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAP1AP62834 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAP1AP62834 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAP1AP62834 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAP1AP62834 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAP1AP62834 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms