Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms