Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
HERVK_113P62684 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms