Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VBP1P61758 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VBP1P61758 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VBP1P61758 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VBP1P61758 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VBP1P61758 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VBP1P61758 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VBP1P61758 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VBP1P61758 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VBP1P61758 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VBP1P61758 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VBP1P61758 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VBP1P61758 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VBP1P61758 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VBP1P61758 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VBP1P61758 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VBP1P61758 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
VBP1P61758 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VBP1P61758 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VBP1P61758 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VBP1P61758 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VBP1P61758 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VBP1P61758 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VBP1P61758 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VBP1P61758 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VBP1P61758 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VBP1P61758 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VBP1P61758 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VBP1P61758 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VBP1P61758 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VBP1P61758 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VBP1P61758 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VBP1P61758 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VBP1P61758 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VBP1P61758 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VBP1P61758 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VBP1P61758 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VBP1P61758 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VBP1P61758 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
VBP1P61758 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VBP1P61758 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VBP1P61758 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VBP1P61758 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
VBP1P61758 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VBP1P61758 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VBP1P61758 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VBP1P61758 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
VBP1P61758 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VBP1P61758 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VBP1P61758 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VBP1P61758 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VBP1P61758 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VBP1P61758 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VBP1P61758 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VBP1P61758 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VBP1P61758 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VBP1P61758 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VBP1P61758 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VBP1P61758 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VBP1P61758 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VBP1P61758 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VBP1P61758 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VBP1P61758 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VBP1P61758 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VBP1P61758 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VBP1P61758 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VBP1P61758 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VBP1P61758 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VBP1P61758 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VBP1P61758 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VBP1P61758 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VBP1P61758 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VBP1P61758 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VBP1P61758 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VBP1P61758 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VBP1P61758 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VBP1P61758 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VBP1P61758 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VBP1P61758 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VBP1P61758 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VBP1P61758 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VBP1P61758 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VBP1P61758 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VBP1P61758 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VBP1P61758 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VBP1P61758 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VBP1P61758 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VBP1P61758 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VBP1P61758 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VBP1P61758 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VBP1P61758 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VBP1P61758 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VBP1P61758 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VBP1P61758 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VBP1P61758 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VBP1P61758 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VBP1P61758 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VBP1P61758 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VBP1P61758 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VBP1P61758 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms