Protein–RNA interactions for Protein: P60900

PSMA6, Proteasome subunit alpha type-6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA6P60900 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMA6P60900 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms