Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MCCD1P59942 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms