Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.8 ms