Protein–RNA interactions for Protein: P52799

EFNB2, Ephrin-B2, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB2P52799 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB2P52799 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms