Protein–RNA interactions for Protein: P51858

HDGF, Hepatoma-derived growth factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFP51858 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDGFP51858 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDGFP51858 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDGFP51858 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDGFP51858 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDGFP51858 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDGFP51858 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDGFP51858 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDGFP51858 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDGFP51858 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDGFP51858 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDGFP51858 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDGFP51858 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
HDGFP51858 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDGFP51858 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDGFP51858 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDGFP51858 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDGFP51858 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDGFP51858 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDGFP51858 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDGFP51858 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
HDGFP51858 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDGFP51858 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
HDGFP51858 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
HDGFP51858 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDGFP51858 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDGFP51858 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDGFP51858 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDGFP51858 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDGFP51858 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDGFP51858 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDGFP51858 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDGFP51858 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
HDGFP51858 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDGFP51858 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDGFP51858 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
HDGFP51858 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
HDGFP51858 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDGFP51858 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
HDGFP51858 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDGFP51858 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
HDGFP51858 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDGFP51858 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDGFP51858 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDGFP51858 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDGFP51858 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDGFP51858 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDGFP51858 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDGFP51858 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDGFP51858 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDGFP51858 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDGFP51858 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDGFP51858 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
HDGFP51858 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDGFP51858 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDGFP51858 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDGFP51858 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
HDGFP51858 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDGFP51858 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDGFP51858 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDGFP51858 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDGFP51858 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDGFP51858 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDGFP51858 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDGFP51858 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDGFP51858 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HDGFP51858 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HDGFP51858 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HDGFP51858 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HDGFP51858 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HDGFP51858 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HDGFP51858 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HDGFP51858 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HDGFP51858 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HDGFP51858 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
HDGFP51858 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HDGFP51858 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HDGFP51858 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HDGFP51858 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
HDGFP51858 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
HDGFP51858 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
HDGFP51858 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
HDGFP51858 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
HDGFP51858 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDGFP51858 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDGFP51858 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDGFP51858 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDGFP51858 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDGFP51858 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDGFP51858 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDGFP51858 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDGFP51858 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDGFP51858 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDGFP51858 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDGFP51858 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDGFP51858 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDGFP51858 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDGFP51858 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDGFP51858 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDGFP51858 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
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