Protein–RNA interactions for Protein: P51610

HCFC1, Host cell factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCFC1P51610 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HCFC1P51610 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms