Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DAP3P51398 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DAP3P51398 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DAP3P51398 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DAP3P51398 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DAP3P51398 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DAP3P51398 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DAP3P51398 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DAP3P51398 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DAP3P51398 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DAP3P51398 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DAP3P51398 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DAP3P51398 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DAP3P51398 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DAP3P51398 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DAP3P51398 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DAP3P51398 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DAP3P51398 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DAP3P51398 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DAP3P51398 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DAP3P51398 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DAP3P51398 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DAP3P51398 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DAP3P51398 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DAP3P51398 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DAP3P51398 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DAP3P51398 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DAP3P51398 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DAP3P51398 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DAP3P51398 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DAP3P51398 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DAP3P51398 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DAP3P51398 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DAP3P51398 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DAP3P51398 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DAP3P51398 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DAP3P51398 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DAP3P51398 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DAP3P51398 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DAP3P51398 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DAP3P51398 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DAP3P51398 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DAP3P51398 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DAP3P51398 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DAP3P51398 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DAP3P51398 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DAP3P51398 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DAP3P51398 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DAP3P51398 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DAP3P51398 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DAP3P51398 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DAP3P51398 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DAP3P51398 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DAP3P51398 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DAP3P51398 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DAP3P51398 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DAP3P51398 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DAP3P51398 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DAP3P51398 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DAP3P51398 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DAP3P51398 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DAP3P51398 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DAP3P51398 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DAP3P51398 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DAP3P51398 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DAP3P51398 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DAP3P51398 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DAP3P51398 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DAP3P51398 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DAP3P51398 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DAP3P51398 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DAP3P51398 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DAP3P51398 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DAP3P51398 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DAP3P51398 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DAP3P51398 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DAP3P51398 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DAP3P51398 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DAP3P51398 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DAP3P51398 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DAP3P51398 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DAP3P51398 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DAP3P51398 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DAP3P51398 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DAP3P51398 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DAP3P51398 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DAP3P51398 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DAP3P51398 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DAP3P51398 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DAP3P51398 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DAP3P51398 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DAP3P51398 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DAP3P51398 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DAP3P51398 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DAP3P51398 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DAP3P51398 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DAP3P51398 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DAP3P51398 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DAP3P51398 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DAP3P51398 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms