Protein–RNA interactions for Protein: P50458

LHX2, LIM/homeobox protein Lhx2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX2P50458 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX2P50458 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX2P50458 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX2P50458 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX2P50458 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX2P50458 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX2P50458 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX2P50458 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX2P50458 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX2P50458 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX2P50458 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX2P50458 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX2P50458 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX2P50458 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX2P50458 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX2P50458 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX2P50458 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX2P50458 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX2P50458 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX2P50458 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX2P50458 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX2P50458 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX2P50458 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX2P50458 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX2P50458 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX2P50458 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX2P50458 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX2P50458 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX2P50458 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX2P50458 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX2P50458 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX2P50458 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX2P50458 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX2P50458 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX2P50458 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX2P50458 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX2P50458 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX2P50458 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX2P50458 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX2P50458 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX2P50458 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX2P50458 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX2P50458 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX2P50458 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX2P50458 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX2P50458 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX2P50458 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX2P50458 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX2P50458 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX2P50458 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX2P50458 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX2P50458 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX2P50458 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX2P50458 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX2P50458 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX2P50458 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX2P50458 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX2P50458 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX2P50458 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX2P50458 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX2P50458 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX2P50458 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX2P50458 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX2P50458 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX2P50458 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX2P50458 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX2P50458 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX2P50458 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX2P50458 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX2P50458 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX2P50458 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX2P50458 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX2P50458 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX2P50458 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX2P50458 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX2P50458 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX2P50458 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX2P50458 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX2P50458 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX2P50458 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX2P50458 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX2P50458 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX2P50458 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX2P50458 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX2P50458 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX2P50458 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX2P50458 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX2P50458 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX2P50458 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX2P50458 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX2P50458 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX2P50458 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX2P50458 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX2P50458 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX2P50458 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX2P50458 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX2P50458 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX2P50458 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX2P50458 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX2P50458 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms