Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NUP153P49790 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NUP153P49790 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NUP153P49790 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NUP153P49790 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NUP153P49790 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NUP153P49790 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NUP153P49790 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NUP153P49790 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NUP153P49790 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NUP153P49790 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NUP153P49790 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NUP153P49790 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
NUP153P49790 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NUP153P49790 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NUP153P49790 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NUP153P49790 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NUP153P49790 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NUP153P49790 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NUP153P49790 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NUP153P49790 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NUP153P49790 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NUP153P49790 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NUP153P49790 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NUP153P49790 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NUP153P49790 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NUP153P49790 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NUP153P49790 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NUP153P49790 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
NUP153P49790 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NUP153P49790 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NUP153P49790 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NUP153P49790 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NUP153P49790 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NUP153P49790 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NUP153P49790 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NUP153P49790 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NUP153P49790 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NUP153P49790 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NUP153P49790 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NUP153P49790 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NUP153P49790 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NUP153P49790 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NUP153P49790 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NUP153P49790 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NUP153P49790 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NUP153P49790 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
NUP153P49790 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NUP153P49790 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NUP153P49790 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
NUP153P49790 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NUP153P49790 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NUP153P49790 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NUP153P49790 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
NUP153P49790 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NUP153P49790 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NUP153P49790 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NUP153P49790 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
NUP153P49790 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NUP153P49790 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NUP153P49790 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
NUP153P49790 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NUP153P49790 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
NUP153P49790 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NUP153P49790 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NUP153P49790 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NUP153P49790 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NUP153P49790 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NUP153P49790 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NUP153P49790 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NUP153P49790 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NUP153P49790 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUP153P49790 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUP153P49790 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUP153P49790 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUP153P49790 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUP153P49790 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUP153P49790 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUP153P49790 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NUP153P49790 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUP153P49790 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUP153P49790 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NUP153P49790 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUP153P49790 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUP153P49790 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NUP153P49790 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUP153P49790 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUP153P49790 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUP153P49790 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUP153P49790 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUP153P49790 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUP153P49790 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUP153P49790 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NUP153P49790 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NUP153P49790 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
NUP153P49790 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NUP153P49790 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
NUP153P49790 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
NUP153P49790 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NUP153P49790 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms