Protein–RNA interactions for Protein: P49189

ALDH9A1, 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH9A1P49189 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALDH9A1P49189 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALDH9A1P49189 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALDH9A1P49189 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALDH9A1P49189 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALDH9A1P49189 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALDH9A1P49189 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALDH9A1P49189 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALDH9A1P49189 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ALDH9A1P49189 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ALDH9A1P49189 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALDH9A1P49189 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALDH9A1P49189 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALDH9A1P49189 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALDH9A1P49189 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALDH9A1P49189 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALDH9A1P49189 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ALDH9A1P49189 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALDH9A1P49189 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALDH9A1P49189 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALDH9A1P49189 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALDH9A1P49189 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALDH9A1P49189 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALDH9A1P49189 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALDH9A1P49189 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALDH9A1P49189 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALDH9A1P49189 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALDH9A1P49189 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALDH9A1P49189 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALDH9A1P49189 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALDH9A1P49189 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALDH9A1P49189 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALDH9A1P49189 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALDH9A1P49189 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALDH9A1P49189 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALDH9A1P49189 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALDH9A1P49189 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALDH9A1P49189 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALDH9A1P49189 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALDH9A1P49189 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALDH9A1P49189 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALDH9A1P49189 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ALDH9A1P49189 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ALDH9A1P49189 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ALDH9A1P49189 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ALDH9A1P49189 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ALDH9A1P49189 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ALDH9A1P49189 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ALDH9A1P49189 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ALDH9A1P49189 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ALDH9A1P49189 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ALDH9A1P49189 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ALDH9A1P49189 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ALDH9A1P49189 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ALDH9A1P49189 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ALDH9A1P49189 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ALDH9A1P49189 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ALDH9A1P49189 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ALDH9A1P49189 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ALDH9A1P49189 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ALDH9A1P49189 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ALDH9A1P49189 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ALDH9A1P49189 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ALDH9A1P49189 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ALDH9A1P49189 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ALDH9A1P49189 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ALDH9A1P49189 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ALDH9A1P49189 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ALDH9A1P49189 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ALDH9A1P49189 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ALDH9A1P49189 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ALDH9A1P49189 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ALDH9A1P49189 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ALDH9A1P49189 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ALDH9A1P49189 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ALDH9A1P49189 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ALDH9A1P49189 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ALDH9A1P49189 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ALDH9A1P49189 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ALDH9A1P49189 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ALDH9A1P49189 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ALDH9A1P49189 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ALDH9A1P49189 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ALDH9A1P49189 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ALDH9A1P49189 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ALDH9A1P49189 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ALDH9A1P49189 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ALDH9A1P49189 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ALDH9A1P49189 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ALDH9A1P49189 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ALDH9A1P49189 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ALDH9A1P49189 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ALDH9A1P49189 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ALDH9A1P49189 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ALDH9A1P49189 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ALDH9A1P49189 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ALDH9A1P49189 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ALDH9A1P49189 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ALDH9A1P49189 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ALDH9A1P49189 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms