Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC4A3P48751 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms