Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDKN1BP46527 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDKN1BP46527 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDKN1BP46527 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CDKN1BP46527 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDKN1BP46527 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDKN1BP46527 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CDKN1BP46527 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CDKN1BP46527 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CDKN1BP46527 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CDKN1BP46527 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CDKN1BP46527 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms