Protein–RNA interactions for Protein: P43003

SLC1A3, Excitatory amino acid transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A3P43003 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC1A3P43003 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms