Protein–RNA interactions for Protein: P40121

CAPG, Macrophage-capping protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPGP40121 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CAPGP40121 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAPGP40121 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAPGP40121 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAPGP40121 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAPGP40121 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CAPGP40121 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAPGP40121 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAPGP40121 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAPGP40121 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAPGP40121 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAPGP40121 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAPGP40121 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAPGP40121 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAPGP40121 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAPGP40121 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAPGP40121 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAPGP40121 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAPGP40121 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAPGP40121 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAPGP40121 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAPGP40121 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAPGP40121 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAPGP40121 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAPGP40121 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CAPGP40121 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CAPGP40121 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAPGP40121 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAPGP40121 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAPGP40121 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAPGP40121 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAPGP40121 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAPGP40121 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAPGP40121 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAPGP40121 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAPGP40121 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAPGP40121 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CAPGP40121 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAPGP40121 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAPGP40121 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAPGP40121 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAPGP40121 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAPGP40121 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPGP40121 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPGP40121 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPGP40121 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPGP40121 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPGP40121 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPGP40121 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPGP40121 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPGP40121 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPGP40121 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPGP40121 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPGP40121 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPGP40121 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPGP40121 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPGP40121 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPGP40121 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPGP40121 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPGP40121 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPGP40121 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPGP40121 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPGP40121 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPGP40121 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPGP40121 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPGP40121 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPGP40121 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPGP40121 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPGP40121 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPGP40121 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPGP40121 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPGP40121 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPGP40121 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPGP40121 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPGP40121 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPGP40121 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPGP40121 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPGP40121 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPGP40121 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPGP40121 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPGP40121 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPGP40121 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPGP40121 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPGP40121 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPGP40121 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPGP40121 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPGP40121 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPGP40121 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPGP40121 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPGP40121 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPGP40121 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPGP40121 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPGP40121 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPGP40121 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPGP40121 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPGP40121 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPGP40121 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAPGP40121 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CAPGP40121 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAPGP40121 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms