Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms