Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJC1P36383 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GJC1P36383 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GJC1P36383 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJC1P36383 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJC1P36383 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GJC1P36383 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJC1P36383 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJC1P36383 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJC1P36383 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJC1P36383 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GJC1P36383 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJC1P36383 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJC1P36383 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GJC1P36383 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJC1P36383 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJC1P36383 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJC1P36383 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJC1P36383 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJC1P36383 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJC1P36383 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJC1P36383 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJC1P36383 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJC1P36383 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJC1P36383 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJC1P36383 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJC1P36383 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJC1P36383 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJC1P36383 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GJC1P36383 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJC1P36383 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJC1P36383 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJC1P36383 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJC1P36383 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJC1P36383 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GJC1P36383 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJC1P36383 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJC1P36383 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJC1P36383 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJC1P36383 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJC1P36383 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJC1P36383 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJC1P36383 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJC1P36383 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJC1P36383 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJC1P36383 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJC1P36383 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJC1P36383 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJC1P36383 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJC1P36383 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJC1P36383 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJC1P36383 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJC1P36383 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJC1P36383 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJC1P36383 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJC1P36383 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJC1P36383 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJC1P36383 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
GJC1P36383 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJC1P36383 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJC1P36383 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJC1P36383 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJC1P36383 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJC1P36383 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
GJC1P36383 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
GJC1P36383 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJC1P36383 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJC1P36383 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJC1P36383 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJC1P36383 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
GJC1P36383 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJC1P36383 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJC1P36383 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJC1P36383 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJC1P36383 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJC1P36383 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJC1P36383 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJC1P36383 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJC1P36383 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GJC1P36383 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GJC1P36383 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GJC1P36383 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
GJC1P36383 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GJC1P36383 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GJC1P36383 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GJC1P36383 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GJC1P36383 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GJC1P36383 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GJC1P36383 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
GJC1P36383 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
GJC1P36383 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
GJC1P36383 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GJC1P36383 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GJC1P36383 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GJC1P36383 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
GJC1P36383 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
GJC1P36383 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GJC1P36383 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GJC1P36383 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GJC1P36383 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms