Protein–RNA interactions for Protein: P35443

THBS4, Thrombospondin-4, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS4P35443 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
THBS4P35443 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
THBS4P35443 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
THBS4P35443 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
THBS4P35443 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
THBS4P35443 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
THBS4P35443 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
THBS4P35443 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
THBS4P35443 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
THBS4P35443 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
THBS4P35443 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
THBS4P35443 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
THBS4P35443 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
THBS4P35443 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
THBS4P35443 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
THBS4P35443 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
THBS4P35443 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
THBS4P35443 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
THBS4P35443 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
THBS4P35443 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
THBS4P35443 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
THBS4P35443 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
THBS4P35443 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
THBS4P35443 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
THBS4P35443 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
THBS4P35443 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
THBS4P35443 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
THBS4P35443 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
THBS4P35443 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
THBS4P35443 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
THBS4P35443 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
THBS4P35443 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
THBS4P35443 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
THBS4P35443 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
THBS4P35443 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
THBS4P35443 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
THBS4P35443 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
THBS4P35443 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
THBS4P35443 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
THBS4P35443 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
THBS4P35443 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
THBS4P35443 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
THBS4P35443 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
THBS4P35443 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
THBS4P35443 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
THBS4P35443 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
THBS4P35443 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
THBS4P35443 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
THBS4P35443 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
THBS4P35443 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
THBS4P35443 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
THBS4P35443 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
THBS4P35443 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
THBS4P35443 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
THBS4P35443 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
THBS4P35443 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
THBS4P35443 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
THBS4P35443 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
THBS4P35443 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
THBS4P35443 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
THBS4P35443 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
THBS4P35443 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
THBS4P35443 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
THBS4P35443 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
THBS4P35443 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
THBS4P35443 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
THBS4P35443 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
THBS4P35443 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
THBS4P35443 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
THBS4P35443 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
THBS4P35443 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
THBS4P35443 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
THBS4P35443 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
THBS4P35443 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
THBS4P35443 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
THBS4P35443 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
THBS4P35443 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
THBS4P35443 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
THBS4P35443 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
THBS4P35443 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
THBS4P35443 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
THBS4P35443 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
THBS4P35443 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
THBS4P35443 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
THBS4P35443 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
THBS4P35443 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
THBS4P35443 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
THBS4P35443 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
THBS4P35443 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
THBS4P35443 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
THBS4P35443 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
THBS4P35443 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
THBS4P35443 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
THBS4P35443 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
THBS4P35443 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
THBS4P35443 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
THBS4P35443 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
THBS4P35443 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
THBS4P35443 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
THBS4P35443 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms