Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ABCC1P33527 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
ABCC1P33527 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ABCC1P33527 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms