Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
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HOXA13P31271 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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