Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ECHS1P30084 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms