Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP1P29466 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP1P29466 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP1P29466 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP1P29466 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP1P29466 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP1P29466 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP1P29466 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP1P29466 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP1P29466 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP1P29466 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP1P29466 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP1P29466 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP1P29466 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP1P29466 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP1P29466 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP1P29466 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP1P29466 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP1P29466 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP1P29466 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP1P29466 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP1P29466 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP1P29466 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP1P29466 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP1P29466 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP1P29466 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP1P29466 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP1P29466 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP1P29466 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP1P29466 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP1P29466 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP1P29466 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP1P29466 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP1P29466 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP1P29466 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP1P29466 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CASP1P29466 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CASP1P29466 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CASP1P29466 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CASP1P29466 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CASP1P29466 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CASP1P29466 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CASP1P29466 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CASP1P29466 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CASP1P29466 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CASP1P29466 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CASP1P29466 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CASP1P29466 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CASP1P29466 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CASP1P29466 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CASP1P29466 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CASP1P29466 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CASP1P29466 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CASP1P29466 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CASP1P29466 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CASP1P29466 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CASP1P29466 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CASP1P29466 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CASP1P29466 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CASP1P29466 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CASP1P29466 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CASP1P29466 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CASP1P29466 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CASP1P29466 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CASP1P29466 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CASP1P29466 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CASP1P29466 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CASP1P29466 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CASP1P29466 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CASP1P29466 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CASP1P29466 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CASP1P29466 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CASP1P29466 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CASP1P29466 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CASP1P29466 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CASP1P29466 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CASP1P29466 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CASP1P29466 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CASP1P29466 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CASP1P29466 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CASP1P29466 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CASP1P29466 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CASP1P29466 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CASP1P29466 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CASP1P29466 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CASP1P29466 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CASP1P29466 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CASP1P29466 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CASP1P29466 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CASP1P29466 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CASP1P29466 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CASP1P29466 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CASP1P29466 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CASP1P29466 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CASP1P29466 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CASP1P29466 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CASP1P29466 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CASP1P29466 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CASP1P29466 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CASP1P29466 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms