Protein–RNA interactions for Protein: P28749

RBL1, Retinoblastoma-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL1P28749 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBL1P28749 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBL1P28749 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBL1P28749 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBL1P28749 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBL1P28749 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBL1P28749 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBL1P28749 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RBL1P28749 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBL1P28749 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBL1P28749 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBL1P28749 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBL1P28749 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBL1P28749 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBL1P28749 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBL1P28749 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBL1P28749 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBL1P28749 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBL1P28749 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBL1P28749 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RBL1P28749 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBL1P28749 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBL1P28749 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBL1P28749 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBL1P28749 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RBL1P28749 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBL1P28749 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBL1P28749 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBL1P28749 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBL1P28749 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBL1P28749 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBL1P28749 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBL1P28749 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBL1P28749 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBL1P28749 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBL1P28749 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBL1P28749 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBL1P28749 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBL1P28749 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RBL1P28749 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBL1P28749 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBL1P28749 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBL1P28749 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBL1P28749 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBL1P28749 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBL1P28749 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBL1P28749 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBL1P28749 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBL1P28749 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBL1P28749 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBL1P28749 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RBL1P28749 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBL1P28749 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBL1P28749 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBL1P28749 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBL1P28749 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBL1P28749 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBL1P28749 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBL1P28749 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBL1P28749 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBL1P28749 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RBL1P28749 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RBL1P28749 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBL1P28749 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBL1P28749 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBL1P28749 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBL1P28749 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBL1P28749 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RBL1P28749 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBL1P28749 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBL1P28749 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBL1P28749 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBL1P28749 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBL1P28749 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBL1P28749 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBL1P28749 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBL1P28749 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBL1P28749 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBL1P28749 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBL1P28749 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBL1P28749 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBL1P28749 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RBL1P28749 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RBL1P28749 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBL1P28749 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBL1P28749 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBL1P28749 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBL1P28749 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBL1P28749 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBL1P28749 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBL1P28749 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBL1P28749 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBL1P28749 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RBL1P28749 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBL1P28749 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBL1P28749 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBL1P28749 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBL1P28749 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBL1P28749 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RBL1P28749 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms