Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABRB3P28472 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABRB3P28472 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABRB3P28472 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABRB3P28472 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABRB3P28472 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABRB3P28472 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABRB3P28472 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABRB3P28472 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABRB3P28472 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABRB3P28472 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABRB3P28472 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABRB3P28472 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABRB3P28472 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABRB3P28472 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABRB3P28472 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABRB3P28472 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABRB3P28472 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABRB3P28472 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABRB3P28472 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GABRB3P28472 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GABRB3P28472 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABRB3P28472 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GABRB3P28472 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABRB3P28472 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABRB3P28472 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GABRB3P28472 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABRB3P28472 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABRB3P28472 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABRB3P28472 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABRB3P28472 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABRB3P28472 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABRB3P28472 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABRB3P28472 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABRB3P28472 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GABRB3P28472 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABRB3P28472 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABRB3P28472 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABRB3P28472 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GABRB3P28472 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRB3P28472 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRB3P28472 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRB3P28472 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRB3P28472 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRB3P28472 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRB3P28472 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRB3P28472 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRB3P28472 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRB3P28472 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRB3P28472 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRB3P28472 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRB3P28472 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRB3P28472 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRB3P28472 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRB3P28472 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRB3P28472 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRB3P28472 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRB3P28472 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRB3P28472 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRB3P28472 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRB3P28472 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRB3P28472 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRB3P28472 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRB3P28472 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRB3P28472 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRB3P28472 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRB3P28472 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRB3P28472 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRB3P28472 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRB3P28472 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRB3P28472 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRB3P28472 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRB3P28472 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRB3P28472 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRB3P28472 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRB3P28472 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms