Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms