Protein–RNA interactions for Protein: P25942

CD40, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 5, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40P25942 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD40P25942 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD40P25942 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD40P25942 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD40P25942 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD40P25942 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD40P25942 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD40P25942 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD40P25942 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD40P25942 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD40P25942 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD40P25942 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD40P25942 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD40P25942 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD40P25942 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD40P25942 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD40P25942 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD40P25942 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD40P25942 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD40P25942 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD40P25942 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD40P25942 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD40P25942 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD40P25942 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD40P25942 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD40P25942 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD40P25942 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD40P25942 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD40P25942 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD40P25942 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD40P25942 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD40P25942 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD40P25942 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD40P25942 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD40P25942 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD40P25942 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD40P25942 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD40P25942 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD40P25942 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD40P25942 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD40P25942 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD40P25942 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD40P25942 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD40P25942 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD40P25942 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CD40P25942 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD40P25942 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CD40P25942 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD40P25942 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD40P25942 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD40P25942 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD40P25942 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD40P25942 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD40P25942 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CD40P25942 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD40P25942 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD40P25942 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD40P25942 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD40P25942 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD40P25942 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD40P25942 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD40P25942 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD40P25942 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD40P25942 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD40P25942 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD40P25942 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD40P25942 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD40P25942 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD40P25942 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD40P25942 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD40P25942 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD40P25942 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD40P25942 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD40P25942 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD40P25942 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD40P25942 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD40P25942 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD40P25942 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD40P25942 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD40P25942 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD40P25942 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD40P25942 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD40P25942 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD40P25942 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD40P25942 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CD40P25942 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD40P25942 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD40P25942 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD40P25942 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CD40P25942 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD40P25942 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD40P25942 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD40P25942 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD40P25942 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CD40P25942 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD40P25942 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD40P25942 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD40P25942 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD40P25942 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD40P25942 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms