Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMO2P25791 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMO2P25791 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMO2P25791 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMO2P25791 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMO2P25791 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMO2P25791 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMO2P25791 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMO2P25791 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMO2P25791 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMO2P25791 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMO2P25791 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMO2P25791 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMO2P25791 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.62
LMO2P25791 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
LMO2P25791 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
LMO2P25791 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
LMO2P25791 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
LMO2P25791 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMO2P25791 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMO2P25791 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMO2P25791 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMO2P25791 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMO2P25791 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMO2P25791 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
LMO2P25791 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
LMO2P25791 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMO2P25791 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMO2P25791 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMO2P25791 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMO2P25791 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMO2P25791 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMO2P25791 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
LMO2P25791 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMO2P25791 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMO2P25791 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMO2P25791 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMO2P25791 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMO2P25791 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMO2P25791 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMO2P25791 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMO2P25791 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMO2P25791 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMO2P25791 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMO2P25791 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMO2P25791 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMO2P25791 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMO2P25791 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMO2P25791 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMO2P25791 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMO2P25791 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMO2P25791 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMO2P25791 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMO2P25791 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMO2P25791 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMO2P25791 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMO2P25791 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
LMO2P25791 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMO2P25791 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMO2P25791 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMO2P25791 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMO2P25791 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMO2P25791 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMO2P25791 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMO2P25791 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMO2P25791 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMO2P25791 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMO2P25791 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMO2P25791 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMO2P25791 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMO2P25791 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMO2P25791 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMO2P25791 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMO2P25791 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMO2P25791 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMO2P25791 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMO2P25791 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMO2P25791 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMO2P25791 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMO2P25791 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
LMO2P25791 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
LMO2P25791 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
LMO2P25791 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMO2P25791 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMO2P25791 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMO2P25791 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMO2P25791 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMO2P25791 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMO2P25791 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMO2P25791 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMO2P25791 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMO2P25791 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMO2P25791 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMO2P25791 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMO2P25791 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMO2P25791 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMO2P25791 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMO2P25791 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMO2P25791 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMO2P25791 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms