Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VAMP1P23763 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VAMP1P23763 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VAMP1P23763 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VAMP1P23763 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VAMP1P23763 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VAMP1P23763 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VAMP1P23763 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VAMP1P23763 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VAMP1P23763 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VAMP1P23763 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VAMP1P23763 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VAMP1P23763 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VAMP1P23763 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VAMP1P23763 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VAMP1P23763 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
VAMP1P23763 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VAMP1P23763 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VAMP1P23763 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VAMP1P23763 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VAMP1P23763 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VAMP1P23763 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VAMP1P23763 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VAMP1P23763 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VAMP1P23763 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VAMP1P23763 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VAMP1P23763 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VAMP1P23763 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VAMP1P23763 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VAMP1P23763 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VAMP1P23763 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VAMP1P23763 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VAMP1P23763 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAMP1P23763 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAMP1P23763 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAMP1P23763 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VAMP1P23763 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAMP1P23763 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAMP1P23763 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAMP1P23763 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms