Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms