Protein–RNA interactions for Protein: P22612

PRKACG, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACGP22612 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKACGP22612 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms