Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms